El Laboratorio Municipal se ocupa del control de los alimentos en establecimientos de hostelería, comedores escolares, escuelas infantiles, residencias, centros de mayores, etc. También es su responsabilidad el control de aguas de consumo, aguas recreativas, fuentes ornamentales, etc.
Comenzó su andadura en el año 1982, realizando los controles analíticos de los primeros programas municipales del departamento de Salud. En 1991, fue designado Laboratorio de Referencia por la Dirección General de Salud Pública de la Comunidad de Madrid. Dos años después, se integró en la Red de Laboratorios de Salud Pública. Y, en 1994, pasó a formar parte de la Red Palinológica, dentro del Programa Regional de Control y Vigilancia del Asma de la Comunidad de Madrid, facilitando los datos de los niveles de pólenes alergénicos que se encuentran en el aire de Alcobendas.